Το Πρόγραμμα Ακαδημαϊκών Μεταπτυχιακών Σπουδών στη Διοίκηση στο FGV EBAPE αποτελείται από MSc και PhD στη Διοίκηση. Στενά συνδεδεμένα, αυτά τα μαθήματα μοιράζονται τις ίδιες αξίες και αρχές. Ο κύριος σκοπός του προγράμματος MSc είναι να προετοιμάσει τους φοιτητές για διδακτορικά (στο FGV EBAPE ή σε κάποιο άλλο διακεκριμένο ίδρυμα στη Βραζιλία ή αλλού στον κόσμο) ή για την αγορά εργασίας. Ο κύριος σκοπός του Ph.D. Το πρόγραμμα είναι να προετοιμάσει τους φοιτητές για ακαδημαϊκή σταδιοδρομία ως καθηγητές ερευνητών σε πανεπιστήμια ή άλλα ακαδημαϊκά ιδρύματα στη Βραζιλία ή στο εξωτερικό.