Οι μελέτες οικοσυστημάτων μπορούν να επικεντρωθούν στις αλληλένδετες σχέσεις μεταξύ των οργανισμών και του περιβάλλοντος τους. Εκτός από το να μάθουν πώς οι φυτικοί και ζωικοί πληθυσμοί καθιερώνονται και ευδοκιμούν, οι μαθητές μπορούν να ακολουθήσουν εξειδικευμένα θέματα σε τομείς όπως η αειφορία, η περιβαλλοντική δικαιοσύνη και η διατήρηση.

Οι απαιτήσεις για το πρόγραμμα Διδακτορικού (PhD) συχνά περιλαμβάνουν το να έχει αποκτήσει ήδη ο φοιτητής ένα Μεταπτυχιακό. Επιπλέον, πρέπει να υποβληθεί μια διατριβή ή πτυχιακή που κατά κύριο λόγο αποτελείται από πρωτότυπη ακαδημαϊκή έρευνα. Σε ορισμένες χώρες, αυτή η εργασία μπορεί ακόμη και να χρειαστεί να υπερασπιστεί μπροστά σε ένα πάνελ.